Exitem cinco elementos principais, que são: Fogo (Katon), Água (Suiton), Terra (Doton), Vento (Fuuton) e Raio (Raiton).
Katon - O Katon ("Elemento Fogo") é um dos cinco principais elementos do chakra. Com esse elemento, o ninja pode usar jutsus à base de fogo, entre esses jutsus, um dos mais conhecidos é o Katon: Goukakyū no Jutsu. Katon é superior ao Fuuton (elemento vento) e inferior ao Suiton(elemento água).
O Katon é um elemento conhecido por ser usado basicamente pelo Clã Uchiha.
Suiton - O Suiton ("Elemento Água") é um dos cinco principais elementos do chakra. O elemento Suiton dá a capacidade para o ninja poder criar ondas de águas ou formar paredes de água, um exemplo desse elemento é o Suiton: Baku Suishōha. O Suiton é superior ao Katon (elemento fogo) e inferior ao Doton (elemento terra).
O Segundo Hokage foi um dos poucos ninjas conhecidos a utilizar Suiton em um lugar sem nem mesmo haver existência de água nele.
Doton - ("Elemento Terra")
Fuuton - O ("Elemento Vento") é um dos cinco principais elementos do chakra. Os jutsus com Fuuton podem varira de uma rajada de vento até poderosas tempestades, um jutsu muito poderosos com o elemento vento é o Fuuton: Rasen Shuriken. O Fuuton é superior ao Raiton (elemento vento) e inferior ao Katon (elemento fogo).
Além disso, há rumores de que é muito raro um ninja com elemento Fuuton, e Naruto é um desses ninjas.
Raiton - O ("Elemento Trovão") é um dos cinco principais elementos do chakra. Os jutsus com Raiton são à base de eletricidade, Raikiri é um exemplo de jutsu com Raiton. Raiton é superior ao Doton (elemento terra) e inferior ao Fuuton (elemento vento).